Historia to zbiór historyczny całego świata shinobi, zawierający odniesienia oraz informacje co do przeszłości całego świata, łącznie z osobami, które w wybranych ramach czasowych żyły, oraz wydarzeniami, jakie nastąpiły.
I Era
Okres historyczny: 2008-2009
Narodzenie świata
Świat powstał w 2008 roku rozpoczynając cały bieg historyczny. Wyróżniającym dla tego okresu czasu był brak wiosek shinobi, gdzie cały system shinobi operował w akademii wspólnoty shinobi. Obok akademii stacjonował budynek stworzyciela, gdzie były formowane trzyosobowe drużyny ninja składające się z trzech osób o randze Genin. W akademii znajdowało się specjalne pomieszczenie, gdzie można było wybrać wygląd postaci w zależności od tego, w którą stronę ścieżki rozwoju chciał iść. Kreowana postać była jedną z obecnych już w uniwersum, jak Naruto, Sasuke, czy Sakura. Nie było możliwości wyboru specjalizacji, klanu, lub natury chakry. Techniki można było otrzymać za ryo, które kupowaliśmy w sklepie obok akademii.
Świat po narodzeniu
Świat był miejscem narodzin wielu ważnych osobistości. Za dawnych czasów można skojarzyć takich shinobi jak Sassuke, Milo, Stobiego, Darka czy trójkę prekursorów, których walka nakreśliła dalszy przebieg świata.
Wąż
Obok znanych shinobi, świat ten był atakowany przez demony. Jednym z nich był Arachis, który podstępem i manipulacją chciał doprowadzić do zniszczenia świata shinobi. Wola shinobi powstrzymała jednak jego zamiary, odciągając stworzyciela od sugestii węża, ukrócając jego życie raz na zawsze, pieczętując je w czeluściach piekła.
Prastarzy
Przodkami wszystkich shinobi były trzy osoby, których umiejętności pozwoliły wydać na świat kolejne pokolenia shinobi w przyszłości. Seiton, bazujący na wysokim intelekcie i wiedzy, Neji, wykorzystujący potęgę postaci oraz moc, jak też Aki, polegający na chytrości oraz zapale do walki. Prekursorzy nakreślili dalszy przebieg świata shinobi, kiedy ich potęga w dalszym ciągu rosła w siłę.
Przewrót
Pewnego dnia wszystko uległo zmianie. Potęga trzech prekursorów była nie do zatrzymania, wyzwalając pojedynek między nimi na śmierć i życie, podczas którego zwycięsko wyszedł tylko Aki. Seiton, mimo ogromnej wiedzy oraz mądrości, wykorzystał ją do wprowadzenia dyktatury, która wykorzystywała młodych chłopców do oddawania mu wszystkiego co mają, w zamian za bezpieczeństwo oraz dalsze życie. Jego rządy spowodowały ostateczną walkę, podczas której został bestialsko zabity przez dwójkę prekursorów, wyzwalając świat od tyrana. Neji, który odniósł poważne obrażenia podczas walki, zmarł chwilę później, a słuch po nim zaginął. Aki przed śmiercią powierzył swoją wolę Stobiemu, który w przyszłości przydział na jego cześć przydomek Aki.
II Era
Okres historyczny 2009-2010
?
III Era
Okres historyczny 2010-2013
?
IV Era
Okres historyczny 2013-2018
?
V Era
Okres historyczny 2018-2020
?