To specjalne misje, które nawiązują do oryginalnej fabuły mangi Naruto. Trzeba je wykonać w odpowiedniej kolejności, spełniając przy tym odpowiednie wymagania. Za każdą otrzymujemy specjalne wynagrodzenie. Misje dzielimy na trzy typy. Wyróżniamy misje fabularne , które opierają się na oryginalnej fabule mangi Naruto, misje poboczne , zawierające historię własną oraz fillery, misje dzienne , które są dziennymi zadaniami rotacyjnymi, zależnymi od naszego poziomu doświadczenia, oraz misje eskortowe , polegające na eskorcie określonej osoby do wyznaczonego miejsca.
Każda misja fabularna przyznaje dodatkowe 10% potrzebnego doświadczenia do kolejnego poziomu doświadczenia.
Część Pierwsza
1. Porozmawiaj z Iruką.
- 500 exp, 1 punkt atrybutów.
2. Zapytaj Mizukiego o zwój Kage Bunshin.
- 500 exp, 1 punkt atrybutów.
3. Spotkaj się z Mizukim we wschodniej jaskini.
- 1000 exp, 1 punkt atrybutów.
4. Użyj techniki Kage Bunshin przy Iruce.
- 1000 exp, 1 punkt atrybutów.
5. Pokonaj Kakashiego na placu treningowym.
- 2000 exp, 1 punkt atrybutów.
6. Przyjmij misję dzienną od Tsunade.
- 2000 exp, 1 punkt atrybutów.
7. Odbierz Tazunę przy wschodnim moście.
- 2000 exp, 1 punkt atrybutów.
8. Pokonaj Demonicznych Braci na swojej drodze.
- 3000 exp, 1 punkt atrybutów.
9. Dostań się do portu Kraju Ognia.
- 3000 exp, 1 punkt atrybutów.
10. Uratuj Inariego.
- 3000 exp, 1 punkt atrybutów.
11. Porozmawiaj z Inarim.
- 3000 exp, 1 punkt atrybutów.
12. Znajdź Tazunę.
- 3000 exp, 1 punkt atrybutów.
13. Dostań się na Most Wielkiego Naruto razem z Tazuną.
- 3000 exp, 1 punkt atrybutów.
14. Ochroń Tazunę pokonując Zabuzę oraz Haku.
- 3500 exp, 1 punkt atrybutów.
15. Zapisz się na egzamin na Chunnina u Anko.
- 4000 exp, 1 punkt atrybutów.
16. Pokonaj Kin.
- 4000 exp, 1 punkt atrybutów.
17. Pokonaj Orochimaru.
- 4000 exp, 1 punkt atrybutów.
18. Znajdź, a następnie pokonaj Shigure.
- 4000 exp, 1 punkt atrybutów.
19. Porozmawiaj z drużyną InoShikaCho.
- 4000 exp, 1 punkt atrybutów.
20. Uratuj Sakurę pokonując Zaku.
- 4000 exp, 1 punkt atrybutów.
21. Pokonaj Dosu.
- 4000 exp, 1 punkt atrybutów.
22. Porozmawiaj z Kabuto o wyjściu z lasu śmierci.
- 4000 exp, 1 punkt atrybutów.
23. Pokonaj prawdziwego Oboro.
- 4000 exp, 1 punkt atrybutów.
24. Przekaż zwój nieba i ziemi Ibikiemu w wieży.
- 4000 exp, 1 punkt atrybutów.
25. Wejdź na arenę egzaminacyjną trzeciej części egzaminów.
- 5000 exp, 1 punkt atrybutów.
26. Pokonaj Kibę oraz Akamaru.
- 5000 exp, 1 punkt atrybutów.
27. Pokonaj Rocka Lee.
- 5000 exp, 1 punkt atrybutów.
28. Pokonaj Nejiego.
- 5000 exp, 1 punkt atrybutów.
29. Wyrusz za Gaarą, a następnie go powstrzymaj.
- 5000 exp, 1 punkt atrybutów.
30. Ochroń wioskę przed atakiem Orochimaru przy pomocy innych.
- 5000 exp, 5 punktów atrybutów.
31. Złóż kwiaty od Ino na grobie Hiruzena.
- 5000 exp, 1 punkt atrybutów.
32. Użyj Oiroke no Jutsu na Jiraiyi.
- 5000 exp, 10000 zwojów kontroli chakry.
33. Sprawdź raport o dwóch członkach Akatsuki na moście przy wiosce.
- 5000 exp, 1 punkt atrybutów.
34. Odeprzyj atak Itachiego oraz Kisame.
- 5000 exp, 1 punkt atrybutów.
35. Znajdź Tsunade w kasynie obok Konohy.
- 6000 exp, 1 punkt atrybutów.
36. Spłać dług Tsunade, lub wykończ najemników.
- 6000 exp, 1 punkt atrybutów.
37. Uratuj Tsunade pokonując Kabuto.
- 6000 exp, 1 punkt atrybutów.
38. Dołącz się do walki Sanninów odpierając atak Orochimaru.
- 6000 exp, 1 punkt atrybutów.
39. Odwiedź Sasuke w szpitalu.
- 6000 exp, 1 punkt atrybutów.
40. Pokonaj Sasuke na dachu szpitala.
- 6000 exp, 1 punkt atrybutów.
41. Wyrusz za Sasuke pokonując Jirobo.
- 7000 exp, 1 punkt atrybutów.
42. Pokonaj na swojej drodze Tayuyę.
- 7000 exp, 1 punkt atrybutów.
43. Pokonaj na swojej drodze Sakona.
- 7000 exp, 1 punkt atrybutów.
44. Pokonaj na swojej drodze Kidomaru.
- 7000 exp, 1 punkt atrybutów.
45. Uratuj Rocka Lee przed Kimmimaro.
- 7000 exp, 1 punkt atrybutów.
46. Dostań się do Doliny Końca.
- 8000 exp, 1 punkt atrybutów.
47. Pokonaj Sasuke.
- 8000 exp, 5 punktów atrybutów.
48. Porozmawiaj z Jiraiyą o tajnej misji rangi S.
- 8000 exp, 1 punkt atrybutów.
49. Zdobądź przynajmniej 50 poziom.
- Druga część wątku fabularnego.
Część Druga
50. Spotkaj się z Sakurą oraz Konohamaru przy bramie wioski.
- 10000 exp.
51. Porozmawiaj z Kakashim na temat treningu.
- 10000 exp.
52. Pokonaj Kakashiego na placu treningowym w Konoha.
- 10000 exp.
53. Przyjmij misję ratunku Kazekage od Tsunade.
- 10000 exp.
54. Wyrusz do Suna Gakure spotkać się z Temari.
- 10000 exp.
55. Uratuj Gaarę przed Akatsuki pokonując Sasoriego w Hiruko.
- 10000 exp.
56. Odbierz leki dla Kankurou od Chiyo.
- 10000 exp.
57. Pokonaj 30% kopię Kisame.
- 10000 exp.
58. Pokonaj 30% kopię Itachiego.
- 10000 exp.
59. Zniszcz bramę bazy Akatsuki.
- 10000 exp.
60. Zabij Sasoriego.
- 10000 exp, 5 punktów atrybutów.
61. Dogoń Deidarę omijając pułapki.
- 10000 exp.
62. Zabierz ciało Gaary od Deidary.
- 10000 exp.
63. Porozmawiaj z Chiyo na temat zakazanej techniki.
- 10000 exp.
64. Złóż kwiaty na grobie Chiyo.
- 10000 exp.
65. Porozmawiaj z nowym kapitanem drużyny: Yamato.
- 15000 exp.
66. Pokonaj Saia.
- 15000 exp.
67. Przy pomocy Yamato zamień się w Sasoriego przy Moście Nieba i Ziemi, a następnie porozmawiaj z Kabuto.
- 15000 exp.
68. Pokonaj Orochimaru na Moście Nieba i Ziemi.
- 15000 exp.
69. Śledź Orochimaru docierając do jego kryjówki.
- 15000 exp.
70. Pokonaj Sasuke na placu treningowym w kryjówce Orochimaru.
- 15000 exp, 5 punktów atrybutów.
71. Poszukaj ciała zaginionej Yugito Nii.
- 20000 exp.
72. Znajdź miejsce wymiany ciał na Ryo.
- 20000 exp.
73. Ochroń Asumę przed Hidanem oraz Kakuzu.
- 20000 exp.
74. Wykończ Hidana oraz Kakuzu w starym lesie.
- 20000 exp, 5 punktów atrybutów.
75. Przekaż Kurenai informację o śmierci Asumy.
- 20000 exp.
76. Zabij Orochimaru w jego kryjówce.
- 20000 exp, 5 punktów atrybutów.
77. Zwerbuj Suigetsu na swoją stronę.
- 20000 exp.
78. Zwerbuj Karin na swoją stronę.
- 20000 exp.
79. Zwerbuj Juugo na swoją stronę.
- 20000 exp.
80. Zabij Deidarę w lasach Konohy.
- 20000 exp, 5 punktów atrybutów.
81. Dostań się do Ame Gakure.
- 20000 exp.
82. Poszukaj informacji o liderze Akatsuki w miejscowym barze.
- 20000 exp.
83. Dostań się do kanałów Ame Gakure.
- 20000 exp.
84. Pokonaj trzy ciała Paina.
- 20000 exp, 5 punktów atrybutów.
85. Wydostań się z kanałów Ame Gakure poprzez dziurę.
- 20000 exp.
86. Porozmawiaj ze swoim trenerem przywołania (Jiraiya, Orochimaru lub Tsunade).
- 20000 exp.
87. Porozmawiaj z mędrcem swojego przywołania (Żaba, Wąż lub Ślimak).
- 20000 exp.
88. Zabij Itachiego w starej twierdzy klanu Uchiha.
- 20000 exp, 5 punktów atrybutów.
89. Zapoluj na Killer Bee w Unraikyo.
- 20000 exp.
90. Poznaj informacje o Jiraiyi od Tsunade.
- 20000 exp.
91. Zniszcz trzy ciała Paina na rynku Konohy podczas ataku.
- 20000 exp.
92. Pomóż Kakashiemu zniszczyć Shurado.
- 20000 exp.
93. Pomóż klanu Hyuuga zniszczyć Jigokudo.
- 20000 exp.
94. Pokonaj Tendo na dachu szpitala.
- 30000 exp.
95. Dogoń, a następnie zniszcz Tendo na terenach Kraju Ognia.
- 30000 exp.
96. Znajdź informacje o położeniu Nagato z ciała Tendo.
- 30000 exp.
97. Dostań się na wyżyny Kraju Ognia znajdując jaskinię Nagato.
- 30000 exp.
98. Porozmawiaj z Nagato.
- 30000 exp.
99. Zdobądź przynajmniej 100 poziom.
- Trzecia część wątku fabularnego, 30000 exp.
Część Trzecia
100. Poznaj informacje o Danzou od Kakashiego.
- 30000 exp.
101. Spotkaj się z Karui przy opuszczonym domostwie.
- 30000 exp.
102. Dostań się na tereny Kraju Żelaza.
- 30000 exp.
103. Porozmawiaj z Raikage.
- 30000 exp.
104. Dostań się do budynku zebrania 5 Kage.
- 30000 exp.
105. Pokonaj Raikage.
- 30000 exp.
106. Powstrzymaj zamach Sasuke oraz Białych Zetsu.
- 30000 exp.
107. Porozmawiaj z Sakurą w Kraju Żelaza.
- 30000 exp.
108. Uratuj Killer Bee przed Kisame w Kraju Żelaza.
- 30000 exp.
109. Dostań się na Błękitny Most Samuraiów.
- 30000 exp.
110. Pokonaj Fu oraz Torune.
- 30000 exp.
111. Zabij Danzou.
- 30000 exp, 5 punktów atrybutów.
112. Dostań się pod Błękitny Most Samuraiów.
- 30000 exp.
113. Uratuj Sakurę przed Sasuke.
- 30000 exp, 5 punktów atrybutów.
114. Wyrusz na wyspę Jinchuuriki.
- 30000 exp.
115. Porozmawiaj z Killer Bee na wyspie Jinchuuriki.
- 30000 exp.
116. Dotrzyj pod wodospad prawdy.
- 30000 exp.
117. Zabij Kisame.
- 30000 exp, 5 punktów atrybutów.
118. Spróbuj udaremnić próbę porwania Yamato na wyspie Jinchuuriki.
- 30000 exp.
119. Pokonaj Tobiego w kanałach Ame Gakure.
- 30000 exp, 5 punktów atrybutów.
120. Dostań się do dywizji Kankurou.
- 40000 exp.
121. Zapieczętuj Sasoriego i Deidarę.
- 40000 exp.
122. Zapieczętuj Shina.
- 40000 exp, 5 punktów atrybutów.
123. Dostań się do dywizji Kakashiego.
- 40000 exp.
124. Zapieczętuj Zabuzę oraz Haku.
- 40000 exp.
125. Zapieczętuj Kuriarare, Jinpachiego oraz Mangetsu.
- 40000 exp, 5 punktów atrybutów.
126. Dostań się do dywizji Daruiego.
- 40000 exp.
127. Zapieczętuj Asumę.
- 40000 exp.
128. Zapieczętuj Dana.
- 40000 exp.
129. Zapieczętuj Kakuzu.
- 40000 exp.
130. Pokonaj Gedo Mazo.
- 40000 exp.
131. Zapieczętuj Kinkaku oraz Ginkaku.
- 40000 exp, 5 punktów atrybutów.
132. Dostań się do dywizji Mifune.
- 40000 exp.
133. Zapieczętuj Hanzou.
- 40000 exp.
134. Zapieczętuj Chiyo oraz Kimmimaro.
- 40000 exp.
135. Dostań się do oddziału medycznego.
- 40000 exp.
136. Wybij wszystkich szpiegów Zetsu.
- 40000 exp.
137. Pomóż Naruto oraz Killer Bee przedostać się obok Tsunade oraz IV Raikage.
- 40000 exp, 5 punktów atrybutów.
138. Dostań się do Naruto oraz Killer Bee podczas najazdu Edo Tensei.
- 40000 exp.
139. Przepędź najazd Edo Tensei.
- 40000 exp.
140. Zapieczętuj Toroiego.
- 40000 exp.
141. Dostań się do dywizji Gaary.
- 40000 exp.
142. Zapieczętuj 4 byłych Kage.
- 40000 exp, 5 punktów atrybutów.
143. Dostań się do Gaary oraz Oonokiego.
- 40000 exp.
144. Przeżyj walkę z Madarą Edo Tensei.
- 50000 exp, 5 punktów atrybutów.
145. Znajdź kryjówkę Kabuto.
- 50000 exp.
146. Pokonaj Kabuto oraz zdejmij technikę Edo Tensei.
- 50000 exp.
147. Znajdź Tobiego w lasach Konohy pokonując Jinchuuriki.
- 50000 exp.
148. Zapieczętuj ciała byłych Jinchuuriki.
- 50000 exp.
149. Pokonaj Tobiego oraz zniszcz jego maskę odkrywając tożsamość.
- Czwarta część wątku fabularnego, 50000 exp, 5 punktów atrybutów.
Część Czwarta
150. Dostań się do jaskini Kabuto.
- 50000 exp.
151. Uwolnij Orochimaru z przeklętej pieczęci Anko.
- 50000 exp.
152. Dostań się do ruin klanu Uzumaki.
- 50000 exp.
153. Pomóż Orochimaru uwolnić dusze byłych Hokage.
- 50000 exp.
154. Dostań się do Naruto oraz Zjednoczonych Shinobi.
- 50000 exp.
155. Zniszcz przywołania z chakry Juubiego.
- 50000 exp, 5 punktów atrybutów.
156. Osłab Juubiego.
- 50000 exp.
157. Dostań się do wymiaru przy pomocy Kakashiego.
- 50000 exp.
158. Zabij Obito.
- 50000 exp, 5 punktów atrybutów.
159. Dostań się do byłych Hokage podczas przemiany Obito w Jinchuuriki Juubiego.
- 50000 exp.
160. Pokonaj Obito Jinchuuriki.
- 50000 exp, 5 punktów atrybutów.
161. Pokonaj ożywionego Madarę.
- 60000 exp, 5 punktów atrybutów.
162. Pokonaj Madarę Jinchuuriki.
- 60000 exp, 5 punktów atrybutów.
163. Wydostań się z wymiaru lawy.
- 70000 exp.
164. Wydostań się z wymiaru lodu.
- 70000 exp.
165. Wydostań się z wymiaru pustynii.
- 70000 exp.
166. Zapieczętuj Czarnego Zetsu.
- 70000 exp.
167. Wyeliminuj Kaguyę.
- 70000 exp, 5 punktów atrybutów.
168. Porozmawiaj z Sasuke.
- 70000 exp.
169. Dostań się do Doliny Końca.
- 70000 exp.
170. Pokonaj Sasuke.
- 80000 exp, 5 punktów atrybutów.
171. Porozmawiaj z Kakashim na temat nadciągającego zagrożenia z księżyca.
- 90000 exp.
172. Dostań się do klanu Hyuuga.
- 90000 exp.
173. Powstrzymaj Otsutsuki Kugutsu przed zabraniem Hinaty.
- 90000 exp.
174. Znajdź jaskinię wspomnień w kraju żelaza.
- 90000 exp.
175. Zniszcz ogromnego kraba.
- 90000 exp, 30 punktów atrybutów.
176. Odnajdź opuszczone miasto na terenach Iwy.
- 90000 exp.
177. Wejdź do Pradawnej Komnaty.
- 90000 exp.
178. Dostań się do księżycowego pałacu.
- 90000 exp.
179. Znajdź Hinatę w księżycowym pałacu a następnie ją uwolnij.
- 90000 exp.
180. Pokonaj Toneriego Otsutsuki na księżycu.
- 90000 exp, 30 punktów atrybutów.
181. Wyrusz razem z Saradą na poszukiwanie kryjówki Sasuke.
- 100000 exp.
182. Pokonaj Shina Uchiha w drodze do kryjówki.
- 100000 exp, 30 punktów atrybutów.
183. Dostań się do kryjówki a następnie porozmawiaj z Sasuke.
- 100000 exp.
184. Odeprzyj atak wroga.
- 100000 exp.
185. Znajdź kryjówkę Orochimaru a następnie z nim porozmawiaj.
- 100000 exp.
186. Przenieś się do wymiaru Shina.
- 100000 exp.
187. Pokonaj 50 Shinów w trzy minuty.
- 100000 exp.
188. Pokonaj główny eksperyment Shina Uchiha.
- 100000 exp, 30 punktów atrybutów.
189. Dostań się do wymiaru z zamkiem Kaguyi.
- 130000 exp.
190. Znajdź zwój z informacjami Kaguyi odpierając atak Kinshikiego.
- 130000 exp.
191. Porozmawiaj z Naruto o zdobytych informacjach.
- 130000 exp.
192. Powstrzymaj inwazję Otsutsuki.
- 130000 exp.
193. Dostań się do wymiaru Otsutsuki.
- 130000 exp.
194. Zabij Kinshikiego.
- 130000 exp.
195. Zniszcz Momoshikiego Otsutsuki.
- 130000 exp, 30 punktów atrybutów.
196. Przyjmij misję eskortową Tento od Naruto.
- 150000 exp.
197. Eskortuj Tento do wyznaczonego miejsca.
- 150000 exp.
198. Pokonaj Shojojiego.
- 150000 ex, 30 punktów atrybutów.
199. Poznaj informacje o organizacji Kara od Sasuke.
- Piąta część wątku fabularnego, 150000 exp.
Część Piąta
200. Odbądź trening z Naruto na polu bitewnym.
- 200000 exp, 10 punktów atrybutów.
201. Porozmawiaj z dawnym znajomym w pociągu Konohy.
- 200000 exp, 10 punktów atrybutów.
202. Odszukaj rozbity sterowiec.
- 200000 exp, 10 punktów atrybutów.
203. Pokonaj Mecha Ao.
- 200000 exp, 30 punktów atrybutów.
204. Dostań się do pojemnika.
- 200000 exp, 10 punktów atrybutów.
205. Zabij Garou.
- 200000 exp, 30 punktów atrybutów.
206. Porozmawiaj z Kawakim.
- 200000 exp, 10 punktów atrybutów.
207. Eskortuj Kawakiego do Zagubionego Ognia.
- 200000 exp, 10 punktów atrybutów.
208. Pokonaj Deltę.
- 200000 exp, 30 punktów atrybutów.
209. Porozmawiaj z Naruto.
- 200000 exp, 10 punktów atrybutów.
210. Zbadaj tablicę przodków w wymiarze Otsutsuki.
- 200000 exp, 10 punktów atrybutów.
211. Przeżyj walkę z Jigenem.
- 200000 exp, 30 punktów atrybutów.
212. Dostań się do zapieczętowanego Naruto.
- 200000 exp, 10 punktów atrybutów.
213. Pokonaj Boro.
- 200000 exp, 30 punktów atrybutów.
214. Uwolnij Naruto z zapieczętowanego naczynia.
- 200000 exp, 10 punktów atrybutów.
215. Przesłuchaj Amado w budynku policji Konohy.
- 200000 exp, 10 punktów atrybutów.
216. Dostań się do kryjówki Kary.
- 200000 exp, 10 punktów atrybutów.
217. Dezaktywuj Deltę.
- 200000 exp, 30 punktów atrybutów.
218. Dostań się do sali tronowej.
- 200000 exp, 10 punktów atrybutów.
219. Zabij Jigena.
- 200000 exp, 30 punktów atrybutów.